当会计在对账时发现资金短缺，可以按照以下步骤进行处理：
重新核对账目
确保没有录入错误，仔细检查所有的会计记录和凭证。
确认是否有未经授权的支出或欺诈行为，必要时报警处理。
审查近期的财务活动
查看是否有异常交易或活动，特别是近期的财务记录。
如果使用的是财务软件或SaaS工具，检查是否有系统漏洞或错误。
与相关人员沟通
了解是否有遗漏或误解，与出纳、财务主管等相关人员进行沟通。
确认出纳的交接手续是否完善，检查出纳会计交接表的余额是否与会计账面库存现金金额相符。
分析和解决问题
根据分析结果，制定解决方案并调整账目。
如果发现是出纳的责任，需按照公司规定进行处理，并确保今后不再发生类似问题。
记录处理过程
详细记录整个处理过程，以便将来参考和避免类似问题。
预防措施
为预防类似情况再次发生，应建立完善的内部控制体系，加强会计人员的培训，并定期进行内部审计。
通过以上步骤，可以有效地解决会计对账时发现的资金短缺问题，并确保账目准确，保障公司资金安全。
