当发票被会计丢失时，应采取以下步骤进行处理：
及时向税务机关报告
发现发票遗失后，应立即以书面形式向主管税务机关报告。对于增值税发票，可以使用电子税务局进行报告。
与开票方沟通
获取开票方提供的已开具发票的记账联复印件，并加盖发票专用章。如果发票已寄出，可能需要从金税卡中重新打印记账联。
发票作废声明
根据税务局要求，在指定报纸上发布发票遗失声明，声明内容包括企业名称、遗失发票的号码、金额、遗失日期等。
账务处理
如果发票联和抵扣联都丢失，可以使用销售方提供的记账联复印件作为增值税进项税额的抵扣凭证、退税凭证或记账凭证。如果发票联丢失，应重新开具发票，并注明丢失发票的相关信息。如果发票遗失前已认证相符，可使用发票联复印件备查；未认证，须到税务机关认证，复印件备查。
税务报表调整
在税务报表中如实反映发票遗失情况，确保报表真实、完整。
罚款处理
如果发票遗失是由于保管不善，可能需要接受税务机关的罚款，罚款应记入“营业外支出”科目。
电子化管理
考虑使用电子发票系统，实现原始发票的电子化管理，提高效率和准确性。
其他注意事项
发票丢失可能需要重新开具发票或进行红冲处理。
企业需及时采取有效措施进行处理，确保账目准确和税务合规。
通过以上步骤，可以有效地处理发票丢失的问题，并确保企业的财务和税务合规。
