女生可以报考的军校研究生专业包括：
国防科技大学：
提供多个专业，如测控技术与仪器、计算机科学与技术、通信工程、指挥自动化工程、自动化、外国语言文学、公共事业管理等。
信息工程大学：
有测绘、电子、无线电、信息研究、计算机、通信、网络、测量工程等专业。
南京陆军指挥学院：
具体专业方向未详细列出，但作为军校，应提供广泛的军事相关课程。
海军工程大学：
虽然未明确列出应用数学专业，但可能提供相近专业。
空军工程大学：
有应用数学专业硕士学位授权点。
火箭军工程大学：
具体专业方向未详细列出，但作为军校，应提供广泛的军事相关课程。
航天工程大学：
女生招生比重较高，专业包括气象、电子、计算机、信息、通信、网络、指挥自动化、系统工程等。
陆军特种作战学院、 陆军防化学院、 陆军军医大学、 海军大连舰艇学院、 海军航空大学、 海军军医大学、 战略支援部队航天工程大学、 战略支援部队信息工程大学、 解放军国际关系学院、 国防大学政治学院、 解放军理工大学、 中国人民解放军国防科技大学、 中国人民解放军后勤工程学院等。
建议：
国防科技大学作为国内顶尖的军校，拥有雄厚的学术科研实力，适合各种专业背景的女生报考。
信息工程大学和航天工程大学在女生招生方面较为友好，专业设置也较为全面。
解放军理工大学和 战略支援部队信息工程大学在专业设置上较为具体，适合有明确专业兴趣的女生。
具体选择军校和专业时，建议根据个人兴趣、专业方向及职业规划进行综合考虑。
